Масс-спектрометры timsTOF SCP и timsTOF Pro 2 от компании Bruker

Компания Bruker представила новые масс-спектрометры: timsTOF SCP для одноклеточной 4D-протеомики и timsTOF Pro 2, оснащённый последовательной фрагментацией с параллельным накоплением (PASEF^®) для 4D-протеомики и 4D-липидомики.

Масс-спектрометрическая протеомика стала основным направлением современных исследований в понимании биологических функций и механизмов заболеваний. Здоровые или больные ткани, которые кажутся однородными, состоят из клеток с множеством различных протеомов. Задача расшифровки протеомов в каждой отдельной клетке — гетерогенность клеток — является ключом к полному пониманию их функций.

Новые аппараты Bruker timsTOF развивают и открывают новые приложения и методы в непредвзятой протеомике, эпипротеомике/ПТМ-характеристике и непредвзятом глубоком открытии мультиомных биомаркеров, например, в исследованиях жидкостной биопсии рака. Сотрудники компании добились значительного прогресса в области объективной одноклеточной протеомики, фосфопротеомики и плазменной протеомики.

timsTOF SCP

Специализированный сверхвысокочувствительный прибор для объективной одноклеточной протеомики, после лазерного захвата микродиссекции одной или нескольких клеток, а также для обнаружения сверхчувствительных неоантигенов в иммунопептидомике в области иммуноонкологических исследований для обнаружения нео-антигена, где доступный материал ограничен, как в биопсиях игл.

8.1

timsTOF Pro 2

Данный аппарат предлагает более глубокое покрытие протеома: более чем 6 000 белковых групп и гораздо больше, чем 60 000 уникальных пептидов в 60-минутных градиентах. Он обеспечивает чрезвычайно высокую скорость работы с повышенной чувствительностью анализа, требуя при этом минимальное количество образцов.

8.2

С появлением нового поколения timsTOF компания Bruker продолжает революцию в 4D-протеомике с поддержкой CCS, а также в 4D-эпипротеомике, определяемой в широком смысле — как характеристика всех посттрансляционных модификаций белка (PTMs).

Компания Bruker также анонсировала новые возможности в программном обеспечении PaSER поиска в реальном времени для 4D-протеомики. Новый PaSER 2022 предлагает крупномасштабную биоинформатику с поддержкой CCS, использующую уникальные методы tims/PASEF. Например, новый TIMScore™ повышает достоверность идентификации пептидов, используя четвертое измерение крупномасштабных поперечных сечений столкновений (CCS) для всех измеренных пептидов.

Повышенная уверенность при использовании CCS уменьшает двусмысленность избыточных пептидных последовательностей, что приводит к большему количеству белковых групп и уникальным идентификациям пептидов, основанным на том контроле FDR.

8.3