Гены гигантских вирусов эволюционируют независимо от клеток-хозяев
Гигантские вирусы эукариоты, которые в своих размерах доходят до 1,5 мкм и от чего прекрасно видны в оптический микроскоп, имеют внушительное количество оснований генома (около 2,5 млн). В числе этих оснований находятся и гены метаболизма, которые кодируют белки, ответственные, например, за брожение. Учёные говорят о клеточном происхождении таких генов, но не берутся утверждать, что оно характерно для геномов NCLDV. Этот вопрос встал на повестку дня, в результате были изучены участки ДНК более 1,5 млн образцов, хранившихся в инкубаторах биологических лабораторий по всему миру. Не менее 100 тыс. пар оснований, частично относящихся к вирусам морских и пресных водоемов, подверглись изучению на совпадение с NCLDV.
Так, исследования геномов мимивирусов (фикоднавирусов) показали большой разброс в сходстве аминокислот внутри только лишь одного семейства. Все они были распределены в группы в зависимости от показателя сходства (в процентах) — всего получилось порядка 54. Также образовался 31 клад без групповых признаков — они не были выделены в определенную культуру представителей. Причина такого разброса крылась в том, что геномы вирусов имели отличающиеся друг от друга группы белков. Некоторые представители вирусов имели внутри клад кластеры, что также влияло на изменение генома NCLDV. По предположениям учёных, такое явление характерно для горизонтального переноса генов, осуществляющегося в ходе эволюции на различных её отрезках времени.
Геном ДНК-содержащих вирусов содержит гены белков, причастных к процессу метаболизма. Именно эти белки влияют на физиологию клетки-носителя, помогая вирусу размножаться на фоне происходящего ней окислительного стресса. Часть генов вируса показали свою причастность к перестраиванию естественного потока энергии и питательных веществ в хозяине. Таким образом, они вмешиваются в нормальное развитие клетки, принимая участие в регуляции процессинга ДНК. Но это ещё не всё. Учёных удивляет тот факт, что во многих геномах NCLDV обнаруживаются гены, участвующие в метаболизме углерода, что, в целом, свойственно только для клеточной жизни. Однако гигантские вирусы не просто имеют в себе эти гены, но и контролируют каждый этап метаболизма углерода. По всей видимости, NCLDV не только заимствовали у своих хозяев гены метаболизма, но и самостоятельно эволюционировали наравне с ними, приобретая специфические функции, выгодные для их развития.
