Ученые составили полный атлас клеток тимуса
Тимус представляет собой человеческий и животный орган лимфопоэза, в котором созревают и проходят отбор Т-лимфоциты, играющие ключевую роль в формировании адаптивного иммунитета. Процесс специфичный, потому понять траекторию развития Т-лимфоцитов, а также кинетику рекомбинации их рецепторов очень важно для того, чтобы осуществлять более эффективное лечение. Ученые настояли на том, что очень важно описать поведение клеток тимуса, активность генов на протяжении всей их жизни, то есть с момента формирования до прекращения работы.
Как известно, при активном взаимодействии клеток тимуса с другими клетками происходит формирование и созревание Т-лимфоцитов, которые в процессе миграции из костного мозга и печени в виде предшествующих Т-клеток приобретают уникальные последовательности рецепторов. Такой процесс позволяет провести отбор и проверку на функциональность Т-клеток и отсутствие аутоиммунности. Из-за того, что уже к 20 годам тимус прекращает свою работу, резко сокращая выработку Т-клеток, неудивительно, что в пожилом возрасте могут возникнуть болезни аутоиммунного характера. К тому же с этим явлением может быть связано развитие рака и инфекций. Таким образом, понимание поведения клеток тимуса и нюансов протекающего процесса созревания Т-лимфоцитов имеет прикладное значение.
Биологи создали детальный атлас активности клеток тимуса, который базируется на изучении последовательностей РНК, находящихся в базе данных, а это практически 256 тысячи клеток 24 образцов тимуса. Атлас был составлен на основе сравнения экспрессии генов, Т-клеток, В-клеток, врождённых лимфоидных и дендритных клеток, макрофагов, моноцитов, натуральных киллеров — и всё это на разных стадиях их развития. Здесь было упомянуто присутствие фибропластов, клеток стенок сосудов, а также эпителиальных клеток тимуса. Сравнивая экспрессию всех участников атласа посредством аналитического оборудования, учёные смогли сгруппировать каждый вид клеток на мелкие подтипы и, таким образом, выделить около 40 кластеров с разной степенью активности и уникальным профилем экспрессии. Общее описание клеток также включало в себя их поведение во времени, то есть с момента формирования и до прекращения деятельности тимуса. Так биологи смогли проследить динамику созревания Т-лимфоцитов, определить их поведение в каждый момент времени, на разных стадиях отметить наличие активности или её отсутствие, а также пронаблюдать за развитием их предшественников, Т-клеток, и отбором их рецепторов.
