Уровень активности генов может стать ключом к определению времени смерти
Изучение РНК-последовательности открыло факт, что в тканях появляются отчетливые специфические изменения в экспрессии генов после того, как человек скончался.
Ученые выявили специфические картины активности генов, появляющиеся в тканях человека вскоре после смерти. Эти данные, опубликованные 13 февраля 2018 в Nature Communications, могут в один прекрасный день помочь криминалистам определить время смерти и усовершенствовать судебно-медицинский анализ.
Изучая активность генов в 36 различных посмертных образцах тканей человека, Родерик Гиго, специалист по биоинформатике Центра геномного регулирования в Барселоне, и его коллеги обнаружили закономерности в том, как экспрессия гена увеличивалась или уменьшалось со временем.
«Для разных тканей организма реакция на смерть довольно специфична», — рассказывает Гиго газете «Science». Используя электронное контрольно-измерительное оборудование, ученые пришли к выводу, что мышечные гены имеют быстрый всплеск и резкое снижение активности, в то время как активность генов в мозге и селезенке со временем не сильно меняется. Гиго и его коллеги также отметили, что большинство изменений происходит через 7-14 часов после смерти. После этого суммарная транкрипция «кажется, стабилизируется», — пишут исследователи в газете.
Полученные результаты имеют смысл, рассказывает Ильяс Тагкопулос, специалист по компьютерным технологиям из Калифорнийского университета Дэвис, который не участвовал в этой работе. «На клеточном уровне смерть — это каскад реакций, проходящих в разное время и последовательно влияющих на биологические процессы, и контролируют этот каскад гены».
На основе моделей активности генов учеными были разработаны вычислительные модели для прогнозирования времени смерти. Исследователи создали алгоритмы для изучения моделей активности генов, используя данные 399 особей, а затем проверили их, чтобы увидеть, насколько хорошо они предсказали время смерти 129 других. По словам авторов, это были концептуальные модели, но теперь они работают над тем, чтобы сделать их прикладными, полезными в расследовании судебных дел.
В настоящее время судмедэксперты используют температуру тела, изменения в цвете кожи и уровень трупного окоченения, чтобы определить, когда человек умер. Трупное окоченение и трупные пятна работают довольно хорошо, но только как ранние показатели, т.е. они действительно хороши для несколько часов, — говорит Кэролин Рэндо, преподаватель биоархеологии и судебной антропологии Университетского колледжа Лондона. В статье, написанной им для The Times он отмечает, что активность генов может быть хорошим индикатором определения времени смерти в первые 24 часа.
В дополнение к информации о времени смерти, Гиго говорит в «Science», что «изменения в экспрессии генов также могут содержать и маркеры причины смерти».