Выращенные в лаборатории раковые клетки отличны от настоящих раковых клеток
В борьбе с раком научные исследования играют ключевую роль. Но оказывается, что не все исследовательские модели отражают истинную ситуацию с реальным раковым заболеванием у больных. Одной из наиболее популярных моделей исследования рака являются клеточные линии, собранные в результате извлечения клеток из настоящих опухолей человека и их дальнейшего выращивания в лабораторных биоректорах. Недавнее исследование ученых-медиков показало, что такой подход приводит к появлению раковых клеток, которые значительно отличаются от тех, что встречаются у людей.
Возможно, ученых и не удивлены, что созданные в лабораториях линии раковых клеток в некоторой степени уступают другим моделям генетически. Но они были порядком удивлены, что модели генетически модифицированных мышей в сравнении оказались более близкими с опухолевыми образованиями человека. В целом, опухолевые образования — это трехмерные шарики из ткани человека, а мыши, созданные в лабораториях с применением методов генной инженерии, относятся к мышам, у которых по сценарию должен развиться рак. Чтобы это узнать, ученые разработали новый компьютерный метод, который сравнивает в исследовательских моделях последовательности РНК с аналогичными данными, доступными в базе Атласа генома рака.
РНК — хороший объект для определения типа клеток и установления их идентичности. Именно РНК являются главным критерием при установлении степени схожести лабораторных клеток с их человеческими аналогами. Данные по экспрессии РНК являются стандартизированными, легко доступными исследователям и менее подверженными техническим вариациям, которые могут исказить результаты исследования. Таким образом, ученые сравнили данные по экспрессии РНК из примерно 650 линий раковых клеток, около 400 ксенотрансплантатов (опухолевые образования человека, имплантированные мышам), свыше 25 генно-инженерных моделей мышей и почти 130 опухолевых клеток. Сравнивая модели по модальностям, ученые установили, что в среднем мыши, рожденные с помощью генной инженерии, и опухолевые образования имеют более высокую точность транскрипции, чем полученные от пациентов ксенотрансплантаты и клеточные линии, в четырех из пяти типов опухолей.
Следует отметить, что существует значительно меньше образцов опухолевых заболеваний и генно-инженерных моделей мышей, которые потенциально могут повлиять на результаты. Исследователи, похоже, не принимают во внимание эту разницу, но отмечают, что они будут в будущем пополнять базу данных о секвенировании РНК, чтобы повысить надежность результатов.
