Главная  Информация для покупателей  Новости науки  Ученые обнаружили около 4 тысяч новых белковых семейств человеческого мегагенома

Ученые обнаружили около 4 тысяч новых белковых семейств человеческого мегагенома

19 августа 2019


Благодаря ученым из института Стэнфорда (Калифорния, США) было сделано удивительное открытие — большая часть белковых семейств, которых обнаружили ученые, оказалась не представлена в базе данных. Собственно, поэтому и была затруднена их идентификация при различных сторонних исследованиях. В рамках проекта «Микробиом человека» удалось использовать в качестве ресурса около 1800 человеческих метагеномов, представляющих собой совокупный геном сообщества организмов, живущих в определенной области человеческого тела. Ученые попытались определить родственные последовательности, состоящие из коротких белков длиной не более 50 аминокислот. Подобные белки довольно трудно обнаружить, аппаратурой они попросту игнорируются, но их роль в организме весома — они, как минимум, помогают межклеточной коммуникации.

Опираясь на уже известные белки маленькой длины, учёные описали около четырех тысяч белковых семейств, которые в подавляющем количестве не имеют родственников, уже упомянутых в базе данных. С помощью аналитического оборудования и специальной программы, считывающей кодирующие последовательности и вычитающей уже имеющиеся в базе из общей массы, при этом основывающейся на эволюционных подписях, ученым в результате фильтрации массивных данных удалось выделить порядка четырех с половиной тысяч кластеров. Каждый кластер отвечал за отдельное белковое семейство. Ученых интересовали только те последовательности, которые имели сайт для посадки рибосомы.

info23-04-19-imgs_SMM_Feb_2019_0009_25

В результате поиска ранее известными оказались всего около 190 — они или уже имелись в базе доменов, или были схожими с обнаруженными. Это произошло, в частности, потому, что выявление коротких белков сопровождается определенными затруднениями, стандартные методы не могут быть применимы для их обнаружения. Вот почему обычно происходят глобальные пропуски при аннотации геномов, в результате чего выявляются крайне немногочисленные гомологи. Для обнаружения большего количества гомологов ученые сняли ограничения в принципах считывания геномов. Дополнительно к этому был проведён анализ подлинности найденных генов, то есть исследовался факт синтеза РНК с искомых генов. Оказалось, что примерно три четверти гомологов из общего числа найденных имеют статус активных, при этом практически у 40% от общего числа идет одновременно синтез РНК и белка.

Данное открытие очень важно для понимания работы клеток, для получения информации о последовательностях ДНК, ранее никем не описанных. Таким образом, можно найти больше новых белков и изучить их трехмерные структуры.

Другая информация

01 июня 2020
Разработан электрохимический глаз с хорошей адаптивностью и сетчаткой высокого разрешения

Учёные смогли разработать действительно функциональный прибор — речь идёт об электрохимическом глазе, который способен распознавать как минимум четыре буквы: I, Y, A, E.

28 мая 2020
Синтезирован фермент, способный расщепить полиэтилентерефталат на 90%

Фермент кутиназа LCC в 33 раза сильнее прочих, и способен разложить терефталевую кислоту на мономеры более чем на 99% в рекордно короткие сроки — всего за 10 часов.

25 мая 2020
Сделана переоценка видового разнообразия арктических моллюсков

Биота Арктики довольно уязвима к стремительным глобальным климатическим изменениям, в том числе антропогенного характера. Уже 3 три вида моллюсков получили международный статус охраняемых.

21 мая 2020
Стимуляция зрительной коры помогает формировать визуальные образы у слепых

Есть вероятность, что зрение может вернуться, если повлиять на зрительную кору.

18 мая 2020
Детали для самолётов и ракет изготавливают с помощью 3-D печати

По статистике, на сегодняшний день практически 40% промышленных компаний по всему миру внедрили в своё производство современные аддитивные технологии, в частности 3-D печать.

Вся информация


Сайт использует файлы cookies. Продолжая просматривать сайт Вы соглашаетесь с использованием cookies. Хорошо!