Главная  Информация для покупателей  Новости науки  Ученые обнаружили около 4 тысяч новых белковых семейств человеческого мегагенома

Ученые обнаружили около 4 тысяч новых белковых семейств человеческого мегагенома

19 августа 2019


Благодаря ученым из института Стэнфорда (Калифорния, США) было сделано удивительное открытие — большая часть белковых семейств, которых обнаружили ученые, оказалась не представлена в базе данных. Собственно, поэтому и была затруднена их идентификация при различных сторонних исследованиях. В рамках проекта «Микробиом человека» удалось использовать в качестве ресурса около 1800 человеческих метагеномов, представляющих собой совокупный геном сообщества организмов, живущих в определенной области человеческого тела. Ученые попытались определить родственные последовательности, состоящие из коротких белков длиной не более 50 аминокислот. Подобные белки довольно трудно обнаружить, аппаратурой они попросту игнорируются, но их роль в организме весома — они, как минимум, помогают межклеточной коммуникации.

Опираясь на уже известные белки маленькой длины, учёные описали около четырех тысяч белковых семейств, которые в подавляющем количестве не имеют родственников, уже упомянутых в базе данных. С помощью аналитического оборудования и специальной программы, считывающей кодирующие последовательности и вычитающей уже имеющиеся в базе из общей массы, при этом основывающейся на эволюционных подписях, ученым в результате фильтрации массивных данных удалось выделить порядка четырех с половиной тысяч кластеров. Каждый кластер отвечал за отдельное белковое семейство. Ученых интересовали только те последовательности, которые имели сайт для посадки рибосомы.

info23-04-19-imgs_SMM_Feb_2019_0009_25

В результате поиска ранее известными оказались всего около 190 — они или уже имелись в базе доменов, или были схожими с обнаруженными. Это произошло, в частности, потому, что выявление коротких белков сопровождается определенными затруднениями, стандартные методы не могут быть применимы для их обнаружения. Вот почему обычно происходят глобальные пропуски при аннотации геномов, в результате чего выявляются крайне немногочисленные гомологи. Для обнаружения большего количества гомологов ученые сняли ограничения в принципах считывания геномов. Дополнительно к этому был проведён анализ подлинности найденных генов, то есть исследовался факт синтеза РНК с искомых генов. Оказалось, что примерно три четверти гомологов из общего числа найденных имеют статус активных, при этом практически у 40% от общего числа идет одновременно синтез РНК и белка.

Данное открытие очень важно для понимания работы клеток, для получения информации о последовательностях ДНК, ранее никем не описанных. Таким образом, можно найти больше новых белков и изучить их трехмерные структуры.

Другая информация
24 июня 2021
Ранний жизненный стресс приближает появление постоянных коренных зубов

Ученые исследовали область биологического созревания, которая ранее не рассматривалась в литературе о детских невзгодах: молярное прорезывание.

21 июня 2021
Ученые исследовали проблему дозирования вязкоупругих жидкостей

Свойство вязкоупругости приводит исследователей к осмысливанию таких проблем, как медленное разрушение жидких мостиков, их тягучесть и образование капель-спутников.

17 июня 2021
Ученые объяснили, как зрительный аппарат воспринимает 3D-форму и материал поверхностей

Предыдущие работы ученых рассматривали форму и восприятие материала зрительным аппаратом человека как вычислительно некорректные.

14 июня 2021
Реактивация памяти стимулирует обучение двигательным навыкам

Основываясь на механизмах реактивации памяти, ученые проверили, может ли кратковременная реактивация памяти стимулировать обучение двигательным навыкам.

11 июня 2021
В межзвездной среде обнаружен этаноламин

Все существующие клеточные мембраны состоят из фосфолипидов, однако природа первых мембран и происхождение первых фосфолипидов остается неизвестной.

Вся информация


Сайт использует файлы cookies. Продолжая просматривать сайт Вы соглашаетесь с использованием cookies. Хорошо!