Главная  Информация для покупателей  Новости науки  Ученые обнаружили около 4 тысяч новых белковых семейств человеческого мегагенома

Ученые обнаружили около 4 тысяч новых белковых семейств человеческого мегагенома

19 августа 2019


Благодаря ученым из института Стэнфорда (Калифорния, США) было сделано удивительное открытие — большая часть белковых семейств, которых обнаружили ученые, оказалась не представлена в базе данных. Собственно, поэтому и была затруднена их идентификация при различных сторонних исследованиях. В рамках проекта «Микробиом человека» удалось использовать в качестве ресурса около 1800 человеческих метагеномов, представляющих собой совокупный геном сообщества организмов, живущих в определенной области человеческого тела. Ученые попытались определить родственные последовательности, состоящие из коротких белков длиной не более 50 аминокислот. Подобные белки довольно трудно обнаружить, аппаратурой они попросту игнорируются, но их роль в организме весома — они, как минимум, помогают межклеточной коммуникации.

Опираясь на уже известные белки маленькой длины, учёные описали около четырех тысяч белковых семейств, которые в подавляющем количестве не имеют родственников, уже упомянутых в базе данных. С помощью аналитического оборудования и специальной программы, считывающей кодирующие последовательности и вычитающей уже имеющиеся в базе из общей массы, при этом основывающейся на эволюционных подписях, ученым в результате фильтрации массивных данных удалось выделить порядка четырех с половиной тысяч кластеров. Каждый кластер отвечал за отдельное белковое семейство. Ученых интересовали только те последовательности, которые имели сайт для посадки рибосомы.

info23-04-19-imgs_SMM_Feb_2019_0009_25

В результате поиска ранее известными оказались всего около 190 — они или уже имелись в базе доменов, или были схожими с обнаруженными. Это произошло, в частности, потому, что выявление коротких белков сопровождается определенными затруднениями, стандартные методы не могут быть применимы для их обнаружения. Вот почему обычно происходят глобальные пропуски при аннотации геномов, в результате чего выявляются крайне немногочисленные гомологи. Для обнаружения большего количества гомологов ученые сняли ограничения в принципах считывания геномов. Дополнительно к этому был проведён анализ подлинности найденных генов, то есть исследовался факт синтеза РНК с искомых генов. Оказалось, что примерно три четверти гомологов из общего числа найденных имеют статус активных, при этом практически у 40% от общего числа идет одновременно синтез РНК и белка.

Данное открытие очень важно для понимания работы клеток, для получения информации о последовательностях ДНК, ранее никем не описанных. Таким образом, можно найти больше новых белков и изучить их трехмерные структуры.

Другая информация
25 февраля 2021
Найдена «ахиллесова пята» бактерии, вызывающей болезнь Крона

Палочки отлично справляются с атаками иммунной системы человека, выживая в макрофагах за счет имеющегося у них гена PduC.

22 февраля 2021
В Солнечной системе обнаружен самый дальний объект FarFarOut

Объект 2018 AG37 находится от Солнца на расстоянии 132 а.е. Он имеет крайне вытянутую орбиту, год на нём длится около тысячи земных лет.

18 февраля 2021
Жидкие кристаллы приобрели свойство самоорганизации при нагревании

При нагревании жидкие кристаллы обычного типа теряют свою структуру, поэтому пытаются самоорганизоваться на более высоких стадиях, ища более выгодное состояние симметрии.

15 февраля 2021
Переработанный бетон упрочнили с помощью измельченных автомобильных шин

Получился материал, который хоть и уступает стандартному новому бетону, всё же является достаточно прочным и поэтому применимым для определенных целей.

11 февраля 2021
С помощью солнечного света удалось получить прозрачную древесину

Ученые заполнили структуру древесного материала раствором квантовых точек и получили гибкий светящийся материал.

Вся информация


Сайт использует файлы cookies. Продолжая просматривать сайт Вы соглашаетесь с использованием cookies. Хорошо!